Есть производитель (изготовитель) и есть правообладатель. Правообладатель может быть Изготовителем, а может не быть Изготовителем. В приказе Минпромторга, процитированном выше, четко расписано, кто является правообладателем. Общепринятую практику в данном случае рассматривать не надо, чтобы самим себя не путать. Например, есть компании, которые являются официальными представителями зарубежных производителей (изготовителей). Они имеют право вносить СИ в госреестр. Что здесь сложного и непонятного?