Не поняла фразу "нестандартная сертификация".
Если вы собираетесь выпусть СИ не по какому-то там ГОСТу, а по своему собственному ТУ, то пожалуйста, кто вам мешает. Главное для вас чтобы потом ваше СИ было востребовано.
Порядок прохождения процедуры узаконивания вы явно путаете. Если хотите чтобы ваше СИ можно было использовать в сфере ГРОЕИ, то тип данного СИ должен быть сначала утвержден, а потом само СИ поверено.
Сначала проводятся испытания, если надо, то проводят сертификацию, например на электробезопасность, потом тип СИ утверждается со своими метрологическими характеристиками, межповерочным интервалом и методикой поверки. И только после этого такое СИ можно поверять.
Если вы собираетесь выпускать ваше СИ серийно, то и утверждается тип СИ на последующую партию сроком на 5 лет.
Если вы собираетесь разработать/выпустить (или уже изготовили) всего пару штук, то и утверждаете их как единичные СИ с конкретными заводскими номерами, и такое свидетельство бессрочно, пока эти СИ сами "не умрут". Все остальные аналогичные СИ не будут считаться утвержденными типами.
Почитайте, например, порядок утверждения на сайте ВНИИМСа.И ознакомьтесь с самим документом
"Порядок проведения испытаний стандартных образцов или средств измерений в целях утверждения типа, Порядок утверждения типа стандартных образцов или типа средств измерений ..." утвержденный ПРИКАЗОМот 30 ноября 2009 года N 1081 (с изменениями от 25 июня 2013 года)